Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms