Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFP17480 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBTFP17480 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBTFP17480 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBTFP17480 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBTFP17480 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms