Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms