Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms