Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms