Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms