Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms