Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms