Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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