Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms