Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms