Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms