Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN11O75508 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms