Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms