Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms