Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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