Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms