Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms