Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
USP17L23D6RBM5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
USP17L23D6RBM5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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