Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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