Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms