Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms