Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAXBP1Q9Y5B6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms