Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TCAF1Q9Y4C2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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