Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MED16Q9Y2X0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms