Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DOLKQ9UPQ8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DOLKQ9UPQ8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms