Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCML1Q9UN30 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms