Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms