Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms