Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM8A1Q9UBU6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms