Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms