Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms