Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMC3IPQ9P2W1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms