Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD5Q9P267 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms