Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms