Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms