Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCMF1Q9P0J7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCMF1Q9P0J7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCMF1Q9P0J7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCMF1Q9P0J7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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