Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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