Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 862.1 ms