Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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