Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms