Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms