Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms