Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms