Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms