Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms