Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms