Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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