Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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