Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms